Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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