Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HIGD2AQ9BW72 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms