Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDC1Q9BTX1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms