Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF1Q9BSM1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.7 ms