Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF559Q9BR84 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms