Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms