Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RGPD5Q99666 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD5Q99666 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD5Q99666 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD5Q99666 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD5Q99666 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD5Q99666 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD5Q99666 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD5Q99666 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD5Q99666 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms