Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CICQ96RK0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms