Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A9Q96Q91 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms