Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms