Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM17Q96I25 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM17Q96I25 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM17Q96I25 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM17Q96I25 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM17Q96I25 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM17Q96I25 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM17Q96I25 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM17Q96I25 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM17Q96I25 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM17Q96I25 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM17Q96I25 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM17Q96I25 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM17Q96I25 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM17Q96I25 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM17Q96I25 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM17Q96I25 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM17Q96I25 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM17Q96I25 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM17Q96I25 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM17Q96I25 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM17Q96I25 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM17Q96I25 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM17Q96I25 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM17Q96I25 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM17Q96I25 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM17Q96I25 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBM17Q96I25 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBM17Q96I25 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBM17Q96I25 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBM17Q96I25 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBM17Q96I25 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBM17Q96I25 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBM17Q96I25 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms