Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MVB12AQ96EY5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MVB12AQ96EY5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms