Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGF29Q96ES7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGF29Q96ES7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGF29Q96ES7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGF29Q96ES7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGF29Q96ES7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SGF29Q96ES7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGF29Q96ES7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGF29Q96ES7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGF29Q96ES7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SGF29Q96ES7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGF29Q96ES7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SGF29Q96ES7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGF29Q96ES7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGF29Q96ES7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGF29Q96ES7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGF29Q96ES7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGF29Q96ES7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGF29Q96ES7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGF29Q96ES7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGF29Q96ES7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGF29Q96ES7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGF29Q96ES7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms