Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP4Q96EB1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms