Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms