Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
TOPBP1Q92547 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOPBP1Q92547 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms