Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC4Q8WW27 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms