Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF4Q8WV16 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms