Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
HJURPQ8NCD3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HJURPQ8NCD3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms