Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM71DQ8N9W8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM71DQ8N9W8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM71DQ8N9W8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM71DQ8N9W8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM71DQ8N9W8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM71DQ8N9W8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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FAM71DQ8N9W8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM71DQ8N9W8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM71DQ8N9W8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM71DQ8N9W8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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FAM71DQ8N9W8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
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FAM71DQ8N9W8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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FAM71DQ8N9W8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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FAM71DQ8N9W8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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FAM71DQ8N9W8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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FAM71DQ8N9W8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM71DQ8N9W8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM71DQ8N9W8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM71DQ8N9W8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM71DQ8N9W8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM71DQ8N9W8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM71DQ8N9W8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM71DQ8N9W8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM71DQ8N9W8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM71DQ8N9W8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM71DQ8N9W8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM71DQ8N9W8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM71DQ8N9W8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM71DQ8N9W8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM71DQ8N9W8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM71DQ8N9W8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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