Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME8Q8N427 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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