Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms