Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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TRAPPC6BQ86SZ2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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