Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z494

NPHP3, Nephrocystin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3Q7Z494 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHP3Q7Z494 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NPHP3Q7Z494 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NPHP3Q7Z494 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NPHP3Q7Z494 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NPHP3Q7Z494 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NPHP3Q7Z494 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
NPHP3Q7Z494 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NPHP3Q7Z494 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NPHP3Q7Z494 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NPHP3Q7Z494 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPHP3Q7Z494 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NPHP3Q7Z494 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPHP3Q7Z494 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPHP3Q7Z494 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPHP3Q7Z494 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPHP3Q7Z494 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPHP3Q7Z494 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPHP3Q7Z494 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPHP3Q7Z494 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPHP3Q7Z494 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPHP3Q7Z494 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPHP3Q7Z494 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPHP3Q7Z494 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPHP3Q7Z494 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPHP3Q7Z494 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms