Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTF1AQ7RTS3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.9 ms