Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE3Q6ZMZ3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms