Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRAIDQ6UW56 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms