Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN1Q6NZI2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms