Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCTP1Q6DN14 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCTP1Q6DN14 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms