Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CARMIL1Q5VZK9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CARMIL1Q5VZK9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CARMIL1Q5VZK9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CARMIL1Q5VZK9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CARMIL1Q5VZK9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CARMIL1Q5VZK9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CARMIL1Q5VZK9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CARMIL1Q5VZK9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CARMIL1Q5VZK9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CARMIL1Q5VZK9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CARMIL1Q5VZK9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CARMIL1Q5VZK9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CARMIL1Q5VZK9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CARMIL1Q5VZK9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CARMIL1Q5VZK9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CARMIL1Q5VZK9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CARMIL1Q5VZK9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CARMIL1Q5VZK9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CARMIL1Q5VZK9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CARMIL1Q5VZK9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CARMIL1Q5VZK9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CARMIL1Q5VZK9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CARMIL1Q5VZK9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CARMIL1Q5VZK9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CARMIL1Q5VZK9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CARMIL1Q5VZK9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CARMIL1Q5VZK9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CARMIL1Q5VZK9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CARMIL1Q5VZK9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CARMIL1Q5VZK9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CARMIL1Q5VZK9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms