Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 STARD13-AS-240ENST00000609608 865 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 CHAC2-201ENST00000295304 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
CHIC1Q5VXU3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 EAF2-202ENST00000451944 960 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 SPINK1-203ENST00000510027 1188 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 AC010931.3-201ENST00000561647 554 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 C1orf132-204ENST00000637970 1170 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CHIC1Q5VXU3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms