Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q5VSD8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q5VSD8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q5VSD8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q5VSD8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q5VSD8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q5VSD8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q5VSD8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q5VSD8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q5VSD8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Q5VSD8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Q5VSD8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Q5VSD8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q5VSD8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q5VSD8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q5VSD8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q5VSD8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Q5VSD8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q5VSD8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q5VSD8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q5VSD8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q5VSD8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q5VSD8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q5VSD8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms