Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms