Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR44Q5JSH3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
WDR44Q5JSH3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
WDR44Q5JSH3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
WDR44Q5JSH3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
WDR44Q5JSH3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
WDR44Q5JSH3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
WDR44Q5JSH3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
WDR44Q5JSH3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
WDR44Q5JSH3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
WDR44Q5JSH3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
WDR44Q5JSH3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
WDR44Q5JSH3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
WDR44Q5JSH3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
WDR44Q5JSH3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
WDR44Q5JSH3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
WDR44Q5JSH3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
WDR44Q5JSH3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
WDR44Q5JSH3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
WDR44Q5JSH3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
WDR44Q5JSH3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
WDR44Q5JSH3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
WDR44Q5JSH3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
WDR44Q5JSH3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms