Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms