Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms