Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CFAP100Q494V2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP100Q494V2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms