Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC153Q494R4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC153Q494R4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC153Q494R4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC153Q494R4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC153Q494R4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC153Q494R4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC153Q494R4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC153Q494R4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms