Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms