Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDKN3Q16667 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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