Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
LAMA4Q16363 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA4Q16363 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
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