Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USF2Q15853 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USF2Q15853 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USF2Q15853 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USF2Q15853 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USF2Q15853 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USF2Q15853 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USF2Q15853 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USF2Q15853 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USF2Q15853 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USF2Q15853 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USF2Q15853 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USF2Q15853 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USF2Q15853 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USF2Q15853 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USF2Q15853 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USF2Q15853 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USF2Q15853 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF2Q15853 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF2Q15853 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF2Q15853 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF2Q15853 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF2Q15853 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF2Q15853 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF2Q15853 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF2Q15853 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF2Q15853 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF2Q15853 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF2Q15853 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF2Q15853 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF2Q15853 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF2Q15853 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF2Q15853 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF2Q15853 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF2Q15853 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
USF2Q15853 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF2Q15853 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF2Q15853 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF2Q15853 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF2Q15853 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF2Q15853 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF2Q15853 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF2Q15853 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF2Q15853 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF2Q15853 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF2Q15853 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF2Q15853 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF2Q15853 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF2Q15853 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF2Q15853 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF2Q15853 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF2Q15853 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF2Q15853 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF2Q15853 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF2Q15853 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF2Q15853 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF2Q15853 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF2Q15853 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF2Q15853 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF2Q15853 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USF2Q15853 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF2Q15853 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF2Q15853 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF2Q15853 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF2Q15853 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF2Q15853 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF2Q15853 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms