Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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