Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABEP1Q15276 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABEP1Q15276 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABEP1Q15276 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABEP1Q15276 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABEP1Q15276 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABEP1Q15276 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABEP1Q15276 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABEP1Q15276 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABEP1Q15276 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABEP1Q15276 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABEP1Q15276 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RABEP1Q15276 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABEP1Q15276 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABEP1Q15276 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABEP1Q15276 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABEP1Q15276 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABEP1Q15276 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABEP1Q15276 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABEP1Q15276 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABEP1Q15276 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RABEP1Q15276 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RABEP1Q15276 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RABEP1Q15276 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms