Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
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