Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCLAFQ15004 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms