Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NWD1Q149M9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NWD1Q149M9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NWD1Q149M9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NWD1Q149M9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NWD1Q149M9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NWD1Q149M9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NWD1Q149M9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NWD1Q149M9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NWD1Q149M9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NWD1Q149M9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NWD1Q149M9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NWD1Q149M9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NWD1Q149M9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NWD1Q149M9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NWD1Q149M9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NWD1Q149M9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
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