Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMC1AQ14683 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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