Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDC1Q14676 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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