Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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ERV3-1Q14264 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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ERV3-1Q14264 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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ERV3-1Q14264 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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ERV3-1Q14264 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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ERV3-1Q14264 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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ERV3-1Q14264 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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ERV3-1Q14264 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERV3-1Q14264 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms